Спор по НДС начинается, когда инспекция не согласна с вычетами или суммой налога в декларации и готова доначислить налог. У компании есть чёткие сроки на ответ, и пропускать их нельзя.
Спор по НДС — это конфликт между компанией и налоговой о том, сколько налога нужно заплатить. Чаще всего инспекция не принимает вычеты или не верит, что сделка была реальной. Спор не всегда доходит до суда: его можно остановить на первом этапе, если правильно ответить на требование.
Проверку проводит территориальная ИФНС по району Санкт-Петербурга. Основание — сданная декларация (ст. 88 НК РФ) или решение о выездной проверке (ст. 89 НК РФ). Вычеты по НДС принимаются, если выполнены условия ст. 171 и 172 НК РФ, а сделка не попала под ст. 54.1 НК РФ.
Камеральная проверка по НДС идёт по каждой декларации автоматически, заявления от инспекции не требуется. Срок — 2 месяца со дня подачи, при признаках нарушений его продлевают до 3 месяцев (ст. 88 НК РФ). Это то самое продление камеральной проверки по НДС, о котором компания узнаёт из отдельного решения.
Поводом для вопросов служат расхождения с декларациями контрагентов, высокая доля вычетов, заявленное возмещение, резкий рост вычетов к прошлому периоду. Критерии риска перечислены в приказе ФНС от 30.05.2007 № ММ-3-06/333@. Среди них высокая доля вычетов НДС и работа через цепочку посредников.
Если вопросов нет, проверка заканчивается тихо. Если есть, приходит требование.
Налоговая обычно направляет требования по НДС через электронный документооборот. Бывает, что документ приходит только в кабинет налогоплательщика или оператору ЭДО. Дату получения отсчитывают по правилам электронной связи, поэтому проверяйте кабинет регулярно.
В требовании смотрите четыре вещи:
Пояснения в налоговую по НДС пишет бухгалтер, но подписывает директор. Текст должен отвечать на заданный вопрос и опираться на документы: договор, счёт-фактуру, акт, переписку.
Вместо пояснений в тех же 5 рабочих днях можно подать уточнённую декларацию по НДС (ст. 88 НК РФ). Это уместно, когда ошибка действительно есть: не тот период вычета, опечатка в сумме, пропущенная корректировка.
Но уточнённая налоговая декларация по НДС запускает новую камеральную проверку (ст. 88 НК РФ). Прежняя проверка при этом не исчезает бесследно: инспекция уже видела исходные данные. Подавать «уточнёнку» к уменьшению налога без объяснений рискованно. Подавать её, когда налог занижен, нужно до того, как инспекция нашла нарушение: такое правило освобождения от штрафа закреплено в ст. 81 НК РФ.
| Этап | Срок | Норма |
|---|---|---|
| Камеральная проверка по НДС | 2 месяца со дня подачи декларации, продление до 3 месяцев | ст. 88 НК РФ |
| Пояснения по требованию или уточнённая декларация | 5 рабочих дней | ст. 88 НК РФ |
| Документы у самого проверяемого | 10 рабочих дней | ст. 93 НК РФ |
| Встречный запрос по контрагенту | 5 рабочих дней | ст. 93.1 НК РФ |
| Акт по камеральной проверке | 10 рабочих дней после окончания проверки | ст. 100 НК РФ |
| Вручение акта | 5 рабочих дней со дня составления | ст. 100 НК РФ |
| Возражения на акт | 1 месяц со дня получения | ст. 100 НК РФ |
| Решение по материалам проверки | 10 рабочих дней после срока на возражения, можно продлить до 1 месяца | ст. 101 НК РФ |
| Дополнительные мероприятия | до 1 месяца | ст. 101 НК РФ |
| Вступление решения в силу | 1 месяц со дня вручения | ст. 101 НК РФ |
| Апелляционная жалоба в УФНС | 1 месяц со дня вручения решения | ст. 139.1 НК РФ |
| Заявление в арбитражный суд | 3 месяца | ст. 198 АПК РФ |
Таблица листается вбок →
Выездная проверка НДС идёт по другим правилам: 2 месяца, продление до 4, в исключительных случаях до 6 месяцев (ст. 89 НК РФ). Проверяют не более трёх лет, предшествующих году решения.
Доначисление НДС означает, что инспекция в решении указывает недоимку, пени и штраф. Недоимка — сумма налога, которую вы, по мнению инспекции, не заплатили. Пени начисляют за каждый день просрочки (ст. 75 НК РФ). Штраф по ст. 122 НК РФ — 20 % от неуплаченной суммы, при умысле — 40 %. Подробнее о штрафах и пенях мы писали в статье Налоговый штраф: что это значит для компании.
Разберём цифры на условном примере. Инспекция снимает вычет 1 000 000 ₽. Недоимка составит 1 000 000 ₽, штраф по ст. 122 НК РФ — 200 000 ₽, плюс пени за весь срок просрочки.
Отдельно стоит понимать налоговые риски по НДС с 2026 года. Основная ставка выросла до 22 % (ФЗ от 28.11.2025 № 425-ФЗ), поэтому каждый спорный вычет «весит» больше. На УСН порог освобождения от НДС снижен до 20 млн ₽ дохода.
Деньги инспекция берёт из единого налогового счёта. Если требование об уплате не исполнено за 8 рабочих дней (ст. 69, 70 НК РФ), следует решение о взыскании (ст. 46 НК РФ). Затем возможно приостановление операций по счетам (ст. 76 НК РФ). Пока оно действует, банки не открывают новых счетов (п. 12 ст. 76 НК РФ).
Если в решении есть выводы об «обнальных» контрагентах, внимание переходит и к директору. Налоговая сама дела не возбуждает: материалы уходят следователю. Для организаций работает ст. 199 УК РФ с порогом свыше 18 750 000 ₽ за три финансовых года подряд. Часто основание для отказа в вычете — ст. 54.1 НК РФ, и об этом отдельная статья: Разрыв по НДС и отказ в вычете.
Своими силами обычно справляются, пока вопрос один и касается технической ошибки. Позовите налогового юриста, если:
Откройте кабинет налогоплательщика, проверьте входящие документы от инспекции и посчитайте рабочие дни до ответа. Если в требовании есть вопросы по реальности сделок или вычетов, обратитесь за разбором: оспаривание доначислений. Телефон: +7 999 213 95 10, почта: nalog@averso.ru.
Первичная оценка ситуации — бесплатно. Ответим в течение 2 часов в рабочее время.
Запросить консультацию